La principal tarea de la SGCAN es apoyar el desarrollo de un modelo de gestión eficiente para el sector de transporte, que vaya acorde con las necesidades del comercio, las innovaciones tecnológicas y el desarrollo logístico del sector productivo de la región. Dicho modelo de gestión se traduce en contar con un marco normativo eficiente y actualizado de manera permanente en los diferentes modos de transporte, que permita a los operadores disponer de reglas claras en beneficio de usuarios y transportistas.